海關在對申請企業實行AEO認證審核時，一般提前3天通知企業，進入企業第一輪2~3天現場認證，現場認證應嚴厲控制海關認證企業準則，發覺不符合要求，將發出規范整改通知要求企業規范整改工作，企業整改后，海關將實行1~2天現場審核，海關審核后，一般在90~120天做出內通過或不通過的認證結論。

海關實地認證的主要內容如下：

1、認證小組實地審核企業數據。進行實地認證時，要對企業進出口經營數據進行調查審核，并進行實地檢討，需要通過海關企業進出口信譽管理體系審核的數據包含：企業注冊信息數據、企業進出口總值及稅額數據、企業一般貿易、企業加工貿易及保稅進出口、企業減免稅、企業違法、企業申報(傳輸)規范、企業納稅、企業管理要求、外部信譽等數據。

2、認證小組實地核查的主要材料。主要包含：內部控制制度、財務狀態制度、守法規范制度、貿易安全制度、場合安全控制制度、進入安全控制制度、人員安全控制制度、商業伙伴安全控制制度、貨物安全控制制度、集裝箱安全控制制度、運輸工具安全控制制度、危害管理控制制度等，要審核各種必要的制度規章是否健全。

3、實地核實認證小組的重要內容。主要有以下幾個方面:

1）企業注冊信息：如企業名稱、注冊地址、企業法人、企業性質、企業英文名稱、企業英文地址、企業高等管理人員（法人、報關業務負責人、財務負責人）等；

2）企業進出口總值及納稅數據：如企業進出口總值、納稅額、報關單數等；

3）企業一般貿易情形:如一般貿易進出口額、納稅額、報關單數等。

4）企業加工貿易和保稅進出口：如加工貿易進出口、國內出售稅；企業減免稅等；

5）企業違法行動：是否有走私犯法、走私行動，是否有違背海關監視規定的處分、處分金額和處分次數；

6）企業納稅情形：如逾期納稅單數和報關單數，是否超過法定期限尚未納稅，是否隱瞞真實信息訛詐等。

4、認證小組經現場核實后不能整改的項目。企業違法、會計信息、納稅才能、盈利才能、償付才能、管理要求、外部信譽等七項準則企業未達標的，屬于不能立即整改的項目。

由于這些項目整改有必定的時間限制或相關要求，只滿足要求或期滿后再次向海關申請，如發覺走私犯法或持續兩年進入黑名單，或企業償付才能、資產負債率和主營業務利潤率不在安全或正常規模內，屬于不能整改的問題，必需退還申請。

其他項目不符合準則或部分準則的，許可企業進行準則化改良。規范改良期限由海關明確，更長不超過90天，海關依據規范改良明確是否通過認證。

高等認證企業每三年重新認證一次。一般認證企業可以隨時向海關申請認證，一般信譽企業也可以隨時向海關申請認證。但是，如果被海關下調為一般信譽企業或從不老實企業上調為一般信譽企業，企業必需期待一年能力向海關申請認證。不老實企業一年后，海關可以上調為一般信譽企業。

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